800公尺符合落地標準，事故原因仍待分析

1. 當時馬公地區上空有雷達回波籠罩，但仍在適航標準之上，但由於RWY 20並沒有自動落地導引系統(ILS)，僅能以VOR落地，故本次空難應與自動落地系統無關。
2. 關於部分媒體懷疑跟大園空難一樣是駕駛指令跟電腦衝突的說法，目前無法排除，這部分要到解讀黑盒子之後才能確定。是這個原因造成事故的話，飛機製造商ATR集團要買單，因為是原廠設計不良。
3. 而由於適逢颱風期間，部分地區下沉氣流強烈，事故原因也有可能是因為下沉氣流強烈，機師被迫把機頭壓低，但卻遭遇風切變而墜毀，此一說法亦有可能。若真的是這個原因，這是不可抗力因素的意外，怪罪誰都沒有用。
4. 另外，經調閱天氣資料顯示，不論是出發地的高雄，還是目的地的馬公，天氣狀況都符合飛行標準，因此並沒有所謂冒險飛行的問題。一切都按照民航局所發布的電子飛航情報指南操作，目前看來於天氣因素並無不符規定之處。